了文职和武职两种官职。

其中，武职由高到低为宣慰使、宣抚使、招讨使、安抚使、长官使和蛮夷使等等，隶兵部武选清吏司，归各地都司管辖。

文职从高到底为土知府、土知州和土知县等等，隶属吏部验封，各布政使司管辖。

值得一提的是，只有宣慰使、宣抚使和安抚使等武职获得者能称之为土司。

而土知府、土知州和土知县等文职获得者不是土司，只是朝廷任命的一种由土人担任的世袭官员。

为了加强统治和控制，明朝还在重要的土司辖地内设置卫所，驻扎重兵，采用卫所和土司相结合的军事建制。

明代的宣慰使司衙门，也就俗称的土司衙门，设宣慰使一人，从三品；宣慰同知一人，正四品；宣慰副使一人，从四品；宣慰佥事一人，正五品。

宣抚使司衙门也属于土司衙门，设宣抚使一人，从四品，宣抚同知一人，正五品；宣抚副使一人，从五品；宣抚佥事一人，正六品。

无论宣慰使司衙门还是宣抚使司衙门，都俗称土司衙门，其中只有宣慰使和宣抚使由朝廷任命，其余的土官由宣慰使或者宣抚使自行任命。

除了土司衙门的土官外，土司还在自己的辖境内任命地方土官，其职务有总理、家政、舍把、旗长、亲将、总爷、洞长和寨长等职务。

通常来说，无论是土司衙门里的土官，还是地方土官，一般由土司的家族成员担任。

宣抚使和宣慰使定期朝贡，按年交纳定额赋税，称为差发，战时听供朝廷征调，依照朝廷下发的的征发令提供土兵参与作战。

原本，土司所领之兵只有守土之责，无事则荷末而耕，有事则修矛以战，军无远戍之劳，官无养兵之费。

不过，随着土司制度的日趋完备以及与朝廷关系的密切，从明朝开始，土司所辖的土兵就成为了朝廷的重要兵源。