其中，京师六部负责北直隶八府二州的事务，南京六部负责南直隶十四府四州的事务。

必须指出的是，由于京师六部是大明的中央六部，所以南京六部要接受京师六部的领导，南京六部在南直隶的作用相当于地方上的三司。

不过，由于南京六部的级别与京师六部一样，或多或少也有一定的职权，尤其是南京户部分了京师户部不少权力，盐引就是南京户部开出来的，再加上南京兵部负责南直隶的军事，因此南京六部与京师六部之间的明争暗斗自然也是少不了的。

在那些下发的公文中，李云天特别指出，讲武堂是奉宣德帝御令所建，将作为大明最高的军事学府，不仅由福王坐镇，而且由他这个都察院监察御史、翰林院庶吉士担任总教官，兵部和五军都督府的相关官员担任各级教官。

尤为重要的是，李云天颁布了新的武举考试制度，并且放宽了考生参考的条件，不像文举那样需要有秀才的功名才能参加考试，南、北直隶中无论无论民户和军户，只要年满十六周岁而不到二十五周岁、通晓文墨者皆可报名参加。

由于讲武堂毕业后即可成为武官，因此对进入讲武堂的人数进行了严格的限制，其中北直隶录取两百人，而南直隶只录取一百人。

巧合的是，武举南一北二的录取比例，与文举南三北二的录取比例正好相反，虽说这与南北的文风和武风有关，但无形中也是在平衡官场上南北官员的比例。

为了能吸引优秀的人才来应试，李云天还耍了一个心计，随着兵部下发的公文，暗中让人在南北直隶放出风去，宣扬从讲武堂的出来的武官与文举的进士一样，是“天子门生”，将会被安排到兵部、亲军都护府和各都督府中担任职务。

不仅如此，他还杀气腾腾地在告诫南北直隶州府的那些官员，此次武举是皇上开的恩科，倘若有谁怠慢那么必将严惩不贷。