就在事情的风口浪尖，畠山政长突然辞任畠山家管领一职，下一任管领是山名持丰派的斯波义廉。

细川胜元去找足利义仁，尝试说服足利义仁签署畠山义就的追讨令，但是此事败露被山名持丰知晓，故而山名持丰希望利用这次有利的政局来击垮细川胜元。

于是，山名持丰召集了与之结盟的守护大名的士兵包围了将军府，希望足利义仁放逐细川胜元。

足利义仁希望山名持丰能允许在将军府的畠山政长和细川胜元离开，但没有承认要放逐细川胜元，这使得山名持丰派的大名感到不满，于是畠山义就趁着畠山政长离开将军府发动攻击。

畠山政长于是向细川胜元求援，细川胜元于是召集京都的同盟守护大名的士兵进行了反击。

在细川胜元的支持下，畠山政长率兵在上御灵社布阵，足利义仁得知畠山家内斗后曾经尝试禁止，山名持丰让后土御门天皇和后花园上皇到室町亭避难。

畠山政长和畠山义就的战争宣告着倭国正式陷入军阀混战时期，以细川胜元和山名持丰为首的大名拉开了乱世混战的帷幕。

而后，细川胜元从领地四国的九个国家集结兵力，令赤松政则从播磨进攻山名持丰的领地。

不仅如此，细川胜元和山名持丰阵营的人在京都也爆发了激烈的冲突，幕府将军足利义仁曾经尝试调停但最终失败。

细川胜元方面有斯波义敏、畠山政长、赤松政则、京极持清等，大本营在将军驻地幕府，称东军。

山名持丰方面有斯波义廉、畠山义就、一色义直、六角高赖等，大本营在幕府以西的山名持丰邸，称西军。

由倭国的北陆到信越、东海、九州筑前、丰后、豊前的大半、关东地方、东北以及九州部份地区的大名都卷入了其中。

最初，号称官军的东军将西军从内里和花的御所周边驱逐，不