七月底的时候，随着马士英率领刘良佐和黄得功两镇兵马撤回南京，南京朝堂中枢再度陷入到一片争执声中。总的来说，南京一众大臣的分为两派，一派以兵部尚书史可法为首，力主大规模派遣细作潜入京师，多方打探太子朱慈烺和诸王的消息，而另一派则人数众多，包括南京守备太监庐凤总督马士英和魏国公徐弘基等人则主张国不可一日无君，必须要即刻选定人选继承大统，主持朝政。

两派为此争执不下，相比较之下，史可法一派便显得有些势单力孤，最后不得不妥协屈从，这其中最重要的原因是，京师已经陷落将近一月，崇祯皇帝的死讯已经得到确认，虽然太子和诸王迟迟没有确切的消息，但这么长的时间，这些人却是没有一点下落传来。而大顺军方面的消息却是已经确认了永王朱慈炤的死讯，他妄图悄悄的潜出京师，却是被大顺军发现，身中流矢而亡。

至于朱慈炤的弟弟朱慈焕，却仍旧是如同石沉大海，没有半分的消息。

局势演变成如此，太子和定王想来也是凶多吉少。南京的朝堂因此暗流涌动，“定策之功”四个字吸引着每一个朝臣。

其中的人选共有两人，分别是福王朱由崧和潞王朱常淓。此时，朱由崧和朱常淓以及周王朱恭枵崇王世子朱慈燴逃难至淮安三义镇暂避一时。

江南东林党人以钱谦益为首，主张拥立素有贤名的潞王朱常淓，而，这样一来，南京朝中的文臣大多数便立刻有了倾向。其中便包括了南京朝局中举足轻重的张慎言姜曰广高弘图等人。

相较之下，本来处于第一继承顺位。血统与崇祯皇帝一系最为接近的福王朱由崧却暂时处于下风。

东林党人在江南的民间和朝中都具有深厚的影响力，他们的表态，也促使整个中枢向潞王朱常淓有所倾斜。甚至于史可法等重臣已经开始着手拟定诏书，派人前往淮安迎接朱常淓到南京即位。