令本科所有军校生，以连为单位顺序返回宿舍，没有命令不许踏出半步。
陆军部很快得知军校生驱逐校长事件，段祺瑞打算低调处理，但王汝贤将此事报告给袁世凯，大总统震怒命令段祺瑞彻查此事，对于带头闹事者必须严惩，严办。
教育长杨祖德则希望对学生不要过于严酷，亲自去走了段祺瑞的门路。