远等舰需要重新安排舰长、参谋长等人员。

其中，定远号舰长由原定远舰舰副管驾李鼎新出任，参谋长由定远舰帮带大副江仁辉出任；镇远号舰长由原镇远舰帮带大副杨用霖出任，参谋长由镇远舰枪炮大副，留美幼童、北洋水师学堂毕业的曹嘉祥出任。致远号舰长由原帮带大副，留美幼童、北洋水师学堂毕业的陈金揆出任，参谋长由已经改为练习舰的扬威舰帮带大副郑文超调任。其他各舰舰长由原来的管带出任，参谋长由原舰上资历和技术过硬的人员担任，舰员打乱后重新编制，南北洋派系各占一半，同时调北洋水师学堂、福建船政学堂、广州黄埔水师学堂、江南水师学堂等水师学堂的优秀学员和留洋归国学员填充。整个舰队除了莱昂斯和他带来的二十人高级军事顾问团成员外，再没有其他国家的洋人呆在舰队上。而莱昂斯等顾问团人员只作为舰队和战队参谋顾问，没有实际指挥权。

5月25曰，王辰浩向皇家海军舰队司令邓世昌和参谋长林建章下达秘密作战命令，令其到奄美岛附近海域伺机袭击。

当天上午11点，邓世昌召集舰长会议。

“案奉钧座谕令！”

与会诸将顿时起立，成立正姿势，神态庄严肃穆。

陆军将领们称呼王辰浩为王帅或者是大帅，而海军自古跟陆军就尿不到一个壶里，因此为区别海军和陆军的不同，海军将士们则以钧座来代表对王辰浩的敬称。陆军直接称呼王辰浩为王帅或者大帅，让朝廷下不来台。海军不像陆军那样嚣张，海军将领们比较含蓄，钧座是对上级的敬称，海军称呼王辰浩为钧座，就是认同王辰浩是他们的直接上级。而外人看来钧座只是称呼上级的一个敬称而已，因此朝廷也挑不出理来。

当着各舰舰长的面，邓世昌朝着北面拱手一礼，然后宣布了王辰浩的命令。

“钧座谕令！命我舰队前出奄美岛附近海域，伺机袭击曰军运