郑芝龙所部的人马，地面战斗人员，条件合格者并且自愿者，则是编为守备军，共计编有三个守备师，其余条件不合格或不愿意从军者，则是编入屯垦营或运输营、建筑营等过渡一段时间，半年后同样根据自愿原则陆续安排退役。

而海上人员，大部分武装商船以及普通商船被分别编入了三个海上贸易公司里，这三个贸易公司里都是属于工业部控股并管理，郑氏集团里原有的中高层领导人则是在里头占据了不等的股份，某种程度上来说，他们算是连人带船入股，而工业部？他们带‘海上贸易许可证’入股。

而毫无疑问，海上贸易许可证才是最重要的，没有这玩意，都不能在大楚帝国的港口里进行贸易。

而一百多艘战船，则是被整体编入大楚帝国海军，随后和海军原有舰队进行混编。

郑芝龙所部舰队再加上原来陆续投诚的赵新厚所部，大楚帝国原有战舰等，最后被整编为南洋舰队、北洋舰队一共两支远洋舰队。

南洋舰队，以香江为舰队司令部所在，负责大员岛以南的南海海域等。

北洋舰队，以吴淞港为舰队司令部所在，负责大员岛以北的庞大海域。

各远洋舰队，内设第一、第二护卫舰分舰队、第一、第二巡洋舰分舰队等下属分舰队。

此外还有珠江舰队、长江舰队两支内河舰队。

珠江舰队，全面负责珠江水系内河的作战任务。

长江舰队，则是全面负责长江水系的作战任务。

最后，大楚帝国形成了两远洋，两内河，一共四支舰队的结构。

目前拥有搭载三十门火炮以上，被归类而二等巡洋舰的大型战舰有九艘，清一色的原郑芝龙舰队，四艘是老式的福船，五艘是较新式的大型鸟船。

搭载二十门到三十门火炮，被归类为一等护卫舰的战舰，一共三十七艘，半数以上