最后，经此一战，军机处的地位彻底被凸现出来，君权得到了进一步的加强和集中，锦衣卫在此一战表现活跃，把情报网络铺到了关外。而且皇帝趁此战提拔了一些人才，进入了军机处，如史可法、刘肇基等人。

崇祯三年一月，帝册封皇子朱慈恒为太子，以戒严免升殿，百官听宣敕于午门，行十二拜礼。

四月，帝不满陕西焦灼战局，增兵陕西，于陕北将贼众合围，一战而彻底平定陕西，张献忠兵败被杀，李自成不知所踪。

陕西平定后，皇帝修建水运，调南方钱粮，定北方天灾。

自此后五年，大明进入漫长的“崇祯新政”改革时期。

帝改革税收制度，重启商税，改东厂为大明税务局，魏忠贤为首任税务总督。

这一举措效果很明显，东厂番子、锦衣卫和地方官员，形成了一个相互监督、相互制约的局面，虽然东厂动则抄家的狠辣手段遭到百官如潮弹劾，但仅仅崇祯四年一年的税收，就足足顶的上过去三年的总和。

于是，无论是内阁还是六部官员都闭嘴了。

改革的过程自不是一帆风顺的，这期间，皇帝也失败过，例如开海禁一事，由于沿海富商和官员的阻挠，不得不被迫放弃；又如东厂收税期间欺压百姓，鱼肉乡里，激起民变，一度使得税收工作停滞，甚至皇帝不得不暂时罢黜魏忠贤，于次年才复启。

好消息是，大明有钱了，商税征收已成定局，且甘陕山东一带的饥荒由于甘薯的大量普及，得到了有效缓解。

另，皇帝练新军五万，以史可法为帅，以徐光启为新军教官，驻守京师。

大明朝就这样磕磕绊绊走过了五年，这五年，各地灾祸依然频发，时不时有饥民暴动，但相比起原历史，已经好了太多太多。

崇祯六年，帝纳周氏姐妹为妃，同年，丁皇后诞下公主，赐号长平。次年，周氏姐妹诞