案子查办到三月底的时候，朝廷都察院和国安局近乎倾巢出动，在京师和江南成立了五个专案组，皇帝特旨海瑞亲自挂帅——在海瑞的传奇生涯中，写上了最为精彩的一笔。

经查，自万历八年起，朝廷枢密院高官和南京兵部勾结，在实施卫所改革过程中，大量虚做卫所军户名册，侵吞土地和复员补贴，折银超过七十八万两。

欲壑是难填满的，这个腐败集团结成之后，很快就盯上了军改过程中淘汰的大量军械。他们利用江南与日本之间没有禁绝的走私贸易，将大量军械倒卖至正在进行内战的日本，并从中获利超过一百一十五万两。

皇帝得知细情之后，其震怒是可以想见的。这也是这些天朝廷上下众官如履薄冰的原因——三年前的大逮捕带给大家的阴影还是太大了。